Vykdo vietovių, atitinkančių “Natura 2000” teritorijų atrankos kriterijus, atranką, ir kitų institucijų pateiktų pasiūlymų nustatyti minėtas teritorijas nagrinėjimą ir išvadų dėl šių teritorijų nustatymo tikslingumo bei atitinkamų teisės aktų parengimą. Rengia vietovių, atitinkančių „Natura 2000” teritorijų atrankos kriterijus, žemėlapius, juos derina su suinteresuotais asmenimis ir teikia pasiūlymus Aplinkos ministerijai steigti naujas vietoves. Dalyvauja rengiant skaitmenines duomenų formas apie biologinę įvairovę saugomose teritorijose, „Natura 2000” teritorijas, EB svarbos natūralias buveines ir EB svarbos rūšių buveines. Nagrinėja, vertina, teikia išvadas ir rengia raštų projektus dėl Aplinkos ministerijos ir kitų institucijų atsiųstų raštų ir kitų dokumentų, kurie susiję su vertybėmis saugomų rūšių informacinės sistemos, biologinės įvairovės saugomose teritorijose, „Natura 2000” teritorijose, EB svarbos natūraliose buveinėse ir EB svarbos rūšių buveinėse. Nagrinėja ir teikia pastabas gamtotvarkos planams, miškotvarkos projektams, miško priskyrimo miškų grupėms projektams, bendradarbiauja su kitomis institucijomis ir teikia išvadas.
Kontaktai nėra rodomi ir skelbimas nerodomas sąrašuose, kadangi skelbimas neaktyvuotas.