Pagrindinė vyriausiojo specialisto funkcija – investicinių aplinkosauginių projektų, įgyvendinamų su valstybės finansine parama iš Lietuvos aplinkos apsaugos investicijų fondo ir Gaminių ar pakuotės atliekų tvarkymo programų, administravimas:
•administracinio bei aplinkosauginio - techninio atitikimo vertinimas;
• projektų įgyvendinimo eigos priežiūra;
• projektų patikra vietoje;
• bendravimas su projektų vykdytojais bei ekspertais;
• su projektų finansavimu bei įgyvendinimu susijusių ataskaitų, tvarkų ir kitų teisės aktų rengimo inicijavimas bei rengimas;
• suinteresuotų asmenų konsultavimas ir informavimas projektų finansavimo bei priežiūros klausimais.